時代設定：20 BBY — 共和国の黄昏
本作の舞台はヤヴィンの戦いの20年前（20 BBY）、『スター・ウォーズ エピソード3／シスの復讐』の約1年前です。大共和国軍はアウター・リム包囲戦で疲弊し、銀河には不穏な空気が漂っています。
正規軍やジェダイ評議会が公に対処できない裏の脅威を排除するため、ホークス率いる「ゼロ・カンパニー」が影の任務を引き受けます。
敵対勢力：インフィニット・コイル (Infinite Coil)
指導者**クンドリ・ファサム (Kundri Fathom)率いる「インフィニット・コイル」は、生物の神経系を冒しドロイドを狂気へ導く「シャドウ・プレイグ（Shadow Plague）」**を兵器化した狂信的組織です。ゼロ・カンパニーはこの生物兵器の拡散を阻止するため銀河を奔走します。